灵魂副本是游戏中比较有挑战性的玩法。新手刚开始接触的时候可能会觉得有点复杂。事实上，一旦了解了每个级别的要点，就会更容易处理。这个副本一共有四个关卡，分别是槐树之变、三国之乱、清风邪气、翻天覆地，而且难度越来越高。第一级被认为是指导级。它不是以战斗为主，而是要求你找到地图上所有的十个宝箱。地图上有一些阴影区域。只要你坚持走路，把能打开的所有阴影都打开，基本上就不会错过盒子。有时你会遇到左上角有火符挡路。这时，到附近寻找左右两侧的影子机关。踩在上面可以释放火符。这一关不需要战斗，主要目的是让你熟悉地图探索的节奏。
过了第一关，来到第二关三国乱世，你就得开始认真对待了，因为对你的队伍战斗力有着严格的要求。根据经验，想要更稳定地通过这一关，队伍的整体综合战力应该在1.2亿以上。如果新开的服务器战力还没有积累的话，可能会比较困难。这一关的玩法是清除地图上所有含有敌人的草丛和被火烧过的木炭堆。这里有一个小技巧可以帮助你区分：普通的草看起来很普通，而怪物藏身的草看起来更黑更绿。看到草和木炭就进去触发战斗。把它们全部完成就可以了。特别是打掉一些木炭后，地图上会出现一座新的桥梁供你继续前进。很多玩家因为错过了某块木炭而陷入关卡。
青峰化邪的级别，是公认的难点。不仅需要良好的战斗支撑，更重要的是要了解独特的通关机制。战力方面，建议达到5亿左右会比较容易。超过四亿也是有可能的，但是对操作和顺序的要求比较高，有时候也要看一些运气。这一关的核心玩法是不能一气呵成，必须分阶段、有策略地推进。地图上有六排冰块，对应着三条不同的路线，每条路线由两层冰层控制。需要进入副本3次，每次只关注其中一条道路对应的两层冰层，然后瞬移到目标区域获得所有奖励和宝箱，然后果断使用副本的重置功能。重置后，进去打下一条路。例如，您可以先攻击第四和第三车道，然后攻击第五和第六车道。许多新手常犯的一个错误是试图立即通关。那样的话，他们将无法获得所有奖励并完美通过关卡，所以一定要利用好重置功能。
可以根据自己的战斗实力灵活选择通关策略。如果你的队伍战力已经很高，而且你追求效率，你可以直接冲进去，找到并获得地图上的转轮圣王。这个道具可以增加你所有武将的攻击力，然后去找黑衣人决战。如果你的战斗力只是中等水平，那么安全的做法就是不要着急，把外围区域能捡到的宝箱和增益全部拿到，然后通过传送门进入下一个区域，把看到的帐篷和其他据点全部清掉，这样就可以得到火符等道具来强化自己，准备充分后再挑战黑衣人。这样获胜的机会就会大很多。需要有意识地收集和培养主力武将，通过高级招募、各种商店兑换等方式获得武将和碎片。培养时要集中资源，优先提升一到两名核心输出武将的素质、水平和技能。同时，队伍里最好有能抗伤害的前线和控制型武将，这样搭配起来打副本会更稳。记得要跟上装备和战术的水平，把日常任务和活动中节省下来的资源，比如训练丹药、武器精髓等尽量用在主力阵容上。遇到关卡不要灰心，可以回去刷其他副本提升实力再挑战。
